当然，一旦开府建衙成功之后，朱慈烺在后续的很多事物上也需要让渡权力，因此本身也属于一个博弈的过程，好在针对这件事上，吴襄给与了相当大的支持，他同意成为新的太子都督府中军都督，意味着将京营的统帅权让了出来。
除了吴襄进入太子都督府之外，勋贵当中的英国公张世泽、武定侯徐锡登也分别担任都督府左军都督和右军都督，而新乐侯刘文炳则正式接管京营兵权，完成了相对比较顺利的交权过程。
只有刚来的路振飞有些疑虑，他低声道：“千岁，开府一事是不是要同陛下禀告一番？”
“路总督还请放心，在我临行前的时候，已经得到了陛下的同意，并且赏赐了我一把天子剑。”
朱慈烺再一次派人拿出了崇祯赐下的天子剑，恭敬道：“父皇赐予此剑给我，便是为了让我能够在山东平叛安民，开府建衙正在此时。”
“既然如此，臣自当领命。”
路振飞心中再无疑虑，他老老实实交出了自己手中的三万两淮锐卒，当然朱慈烺也没有亏待他，让他成为了太子都督府中的前军都督。
眼看着中军都督、前军都督、左军都督和右军都督都已经有了人选，朱慈烺也就放下心来，他设立的这些都督职位本身都是一个地位比较崇高的幌子而已，本身并没有多少权力，不过他也跟吴襄和路振飞等人谈妥了，等到山东之后，就让他们由军转政，并不会有损他们的权力。
在处理完了这一件堪称最麻烦的事情后，朱慈烺很快就将自己先前准备好的计划公布了出来，即新的太子都督府将会作为全军的最高指挥衙门，并且具备征兵、练兵、治兵以及调兵的所有权力，当然大都督一职由朱慈烺自己兼任。
之所以将这么多的权力都赋予太子都督府，原因就在于朱慈烺要集权，绝不能让南京兵部对自己的权力有任何的影响，而且通过将所有权力一把抓的形式，可以做到更快的反应，在处理事情上更加方便。
因此，在如今的太子都督府下设立有多个部门，包括总参谋部、总作战部、总兵役部、总装备部、总后勤部以及总军法部等，这些部门的权力将会直接涵盖到太子都督府下属军队，全面接受太子都督府的节制。
实际上，对于这一点军中那些有实权的将领们，特别是像吴三桂他们，原本都掌握了军中的所有权力，眼下要求他们接受太子都督府的节制，心中自然不愿意。
朱慈烺也不愿意在这个关键时候搞得太过火，因此他将目前的军队一分为二，一部分为太子都督府直属军队，比如像原本的京营、北伐营、勇卫营一部，还有眼下路振飞带来的三万两淮锐卒，加起来零零散散有六万余人。
至于另一部分便是原本的关宁军，继续由吴三桂统领，只是单纯听从太子都督府作战部的命令，其余事物均由吴三桂自行处理。不过由于关宁军相对精锐，因此战力基本上同目前的太子都督府下属六万军队差不多。
在太子都督府建衙成功之后，朱慈烺也就很快开始了第二步，即从目前的这六万军队当中，选拔一部分年轻且具备战斗力的士兵，成为太子幼军的一员，使他们成为朱慈烺能够直接掌控的军队力量。
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