距离九尾之夜时间虽短，但木叶暗中却发生了许多微妙的变化。
比如，三代火影猿飞日斩遇刺。
火影就任，必须要得到火之国大名的委任书。三代猿飞日斩，不愧是最了解自己战友之人。表面前往火之国大名府，实际猿飞一直在等团藏犯错；稍稍以精锐暗部为饵，便抓住了志村团藏的狐狸尾巴…
团藏自认为自己的“根”已经将三代斩杀在去往大名府的途中，志得意满坐在火影的宝座上。只可惜，得到了护卫暗部受袭的准确消息之后，三代猿飞日斩径直地推开了火影办公室大门：“不好意思，我暂时还不能把这个位置让给其他人…你好像很诧异我为什么还活着？”
团藏的诧异不仅仅是一瞬间的情感失控而已，反叛罪名一旦成立在任何村子都是重罪，木叶自然也不例外：“哪里？因为我听说你今早出发去大名府了…”
“幕后主使是谁一查便知，如此一来，那人就会被治死罪，这点毋庸置疑！”三代的话到这里，团藏已冷汗淋漓。好在，三代话锋一转：“但是，我的主义不允许我伤害更多人。要是见到他，我想对他说，这件事件一概不予追究。但相对的，希望他以后，能够为木叶村尽心尽力！”
话已至此，团藏也没什么可伪装得了：“你还是坚持和平主义，你的天真总有一天会毁了你自己，日斩！”
三代让自己的目光落向窗子外面的村子，算是对今天的事儿做一个了结：“可能吧！”
团藏，与三代猿飞日斩比起来，他的政治手段还是太嫩了。离开宝座、即将离开火影办公室：“从来都是这样，你是光，我是暗！”言语中，饱含多少自嘲与不甘，只有团藏自己一个人清楚。
这就是三代一直以来推崇的理论：有光的地方必定有暗，无论缺少了哪一方，世界都无法正常运作。于是，便有了“根”这一木叶的暗面；于是，便有了“根”唯一领袖团藏。
再比如，三忍之一自来也秘密回村。
四代波风水门身为传说中三忍自来也最欣赏的弟子，自来也如何能不回返木叶吊唁。不过，自来也回来，不为这个“风雨飘摇”村子做点什么就离开，显然是不被三代所答应的。
九尾之夜，实在了伤了三代这个仁厚老者的心。自己几十年出生入死战友团藏，选择袖手旁观；而自己前些年最得力、也是最有希望继承火影之位的弟子大蛇丸，其同样选择置身事外。
木叶，可以接受一个暗面的“根”，但却不可以容纳与团藏走得太近的大蛇丸。三代猿飞日斩经历了多少变故、看过了多少人心。团藏、大蛇丸自认为秘密联系不留任何一点蛛丝马迹，但是…上一任火影人选，身为木叶元老的团藏提名了大蛇丸：固然，大蛇丸早年有团藏部下的身份；固然，大蛇丸本身就是火影之位的人选…不过，三代太了解团藏了，利益至上、不折手段，此人肯开口便意味着一切！
团藏，已然敲打完毕。那么，接下来就轮到自己亲爱的弟子大蛇丸了。三代，他真的不想走到这一步。然而，为了木叶，为了木叶年轻一代的成长，猿飞日斩别无选择：他必须要拿出身为火影的绝对器量，以雷霆手段扫除内部的巨大潜在威胁。只有如此，猿飞日斩才可以放开手应付敌对忍村的接连试探。
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