米利都投降之后，希腊联军再未遭遇任何战斗，一路顺遂，所途经的城镇都纷纷开城投降，直至抵达卡瑞亚地区的首府哈利卡纳苏斯城下。
卡瑞亚地区的沿海城邦和小亚细亚西部的大多数沿海城邦一样曾经是希腊人建立的殖民城，它不但与希腊本土城邦保持着密切联系，而且在几百年的时间里逐渐教化并融合了卡瑞亚地区的土著人，不但该地区的大部分城镇外观与希腊本土城市如出一辙，而且希腊语也成为该地区的通用语言，虽然最终卡瑞亚被波斯帝国征服成为它的一个省区，但该地区仍然同其他小亚细亚西部的地区一样较为独立，甚至该地区的多数城镇被团结在了一个以拉吉那的宙斯神庙为中心的近邻同盟周围，当然它只是一个宗教团体，而不是一个政治实体。
等到阿格西劳斯率领军队将小亚细亚西部搅得一团乱、蒂萨弗里斯因罪被波斯王太后处死之后，卡瑞亚贵族赫卡托姆努斯趁着局势动荡的机会，在卡瑞亚地区建立了统治。此时由于波斯王不但与斯巴达议和，还支持斯巴达在希腊本土的霸权，这引起了小亚细亚西部贵族和民众的极大不满，为了安抚他们，阿尔塔薛西斯在将一个女儿嫁给了法那巴佐斯的儿子的同时，也暂时任命啦赫卡托姆努斯为卡瑞亚总督。
赫卡托姆努斯是一个很精明的人，其儿子摩索拉斯同样如此，他们一直都按时向波斯国库缴纳贡赋，向波斯王表示臣服。在5年前，当小亚细亚西部几乎所有总督都起兵叛乱时，接替父亲担任卡瑞亚总督的摩索拉斯也曾经发生过动摇，他先是保持中立，又在叛军处于劣势的时候倒向了波斯王，并且协助波斯军队彻底剿灭叛乱，因此在战争结束后，他的总督职位得以保留。而在这一段动荡时期，他在卡瑞亚的权利得到了进一步的强化，他不但是波斯官方任命的卡瑞亚总督，而且也是卡瑞亚地区内众多城市的共同僭主。
并且摩索拉斯还将总督的驻地从米拉萨迁移到了哈利卡纳苏斯，不但花费巨资重建哈利卡纳苏斯城，而且还扩建了港口，在城外的小岛泽菲利昂修建了一座坚固的城堡和两个军港，又花费巨资组建了一支舰队，野心勃勃的他显然是要想将卡瑞亚发展成一个海上强国。
由于担心希腊联军的登陆打断他正在实施的计划，这一次他积极的支持法那巴佐斯，不但提供了数量不菲的军队，还成为组建小亚细亚舰队的主要倡导者之一，14的战船数量都是由他慷慨提供，当然他也在筹划着等这场战争结束后如何将小亚细亚舰队的指挥权掌控在自己手中。
可惜，小亚细亚舰队在萨摩斯被戴奥尼亚舰队全歼，给了他重重的一击，接着希腊联军又大败波斯军队，这让他感到了极度的不安，他立刻在卡瑞亚地区进行军事动员，加强了对哈利卡纳苏斯的防御。
他的预料没有错，接下来希腊联军一路势如破竹，沿着海岸东进，已经进入了卡瑞亚地区。
摩索拉斯立刻故伎重施，派出使者面见列奥提奇德斯，向他提出：卡瑞亚愿意在这场战争中保持中立，甚至愿意为希腊联军提供一些财物，为希腊联军通过卡瑞亚地区时提供一些便利，只要希腊联军不再视卡瑞亚为敌人。
摩索拉斯的想法很好，但列奥提奇德斯详细了解过有关卡瑞亚的一些情报，对于狡诈多变的摩索拉斯并不放心，而且卡瑞亚地区实力不弱，他也不放心对这样一个隐患不加处理、就安置在军队的后方，所以他没有接受摩索拉斯的要求，而是提出：卡瑞亚地区必须投降戴奥尼亚！
这当然是野心勃勃的摩索拉斯所不能接受的，于是谈判失败，战端开启。
摩索拉斯深知希腊联军士气正盛，实力强大，与之野战只可能惨败，所以他将兵力收缩至城内，全力防御，以拖延时间，等待战局变化。
赫卡托姆努斯和摩索拉斯父子俩经营了卡瑞亚地区20多年，反对派遭到长期打压，影响力甚微，民众也基本认同这个家族的统治，因此它不可能像以弗所、米利都那样在大军压境的时候出现动荡和暴乱，所以希腊联军除了硬攻，没有其他手段。
然而在城高墙厚、防御严密的哈利卡纳苏斯城下，希腊联军的几次强攻都遭到失败，导致希腊联军的将领们因之前顺利的进攻态势而产生的轻慢心态被一扫而空，不得不耐心地同摩索拉斯展开鏖战。
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4月末，戴弗斯率领大军从达菲奈出发东进，庞大的辎重船队沿海岸并行，经过6天的长途跋涉，穿越了沙漠，并且绕过加沙城，进入迦南地区。随后轻松攻占港口雅法，使其成为大军的资重补给港口。
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